Cari Blog Ini

Memuat...

Rabu, 31 Oktober 2012

2 New Books for Families That Love Science!

This past year has been busy -- but the result has been TWO new books with tons of amazing science and other geeky projects for kids and families!

Geek Mom: Projects, Tips, and Adventures for Moms and Their 21st-Century Families is a new book from Potter Craft co-authored by me and the other editors of Wired.com's GeekMom blog: Natania Barron, Corrina Lawson and Jenny Williams.Written primarily for moms who want to share their geeky interests with their kids, it includes fun activities like superhero costumes, math puzzles, snack food hacks, and science-y crafts, as well as a whole chapter of at-home experiments.

Robotics: Discover the Science and Technology of the Future with 20 Projects, a book for kids ages 9-12 from Nomad Press, is packed full of information about how robots work and contains "low tech/no tech" projects based on actual robotics research. No special tools or skills are needed to build any of the working robotics models in this book -- just ordinary crafts materials and recycled electronics parts!

Both these books are available from Amazon or your favorite local bookstore. You can see sample projects and photos and read more about the books on my website Crafts for Learning, my Amazing Robotics Projects Facebook page, and on GeekMom and GeekDad!

October 29 to November 16, 2012

We will work on cells these two weeks.  Work consists of cell projects, labs on diffusion, computer lab and Jeopardy review!  Advanced biology homework is due Monday, October 29 as well as dates below. 

HOMEWORK DUE DATES:
Nov.  1- 13  due 11/16
Nov. 16 - 30  due 11/30
Dec. 1 - 4  due 12/10

QUIZ - Cell membrane and organelles!

Digestion, Absorption, Assimilation (Simple explanation)




Human Digestion
Mouth
Salivary glands produce saliva which contains salivary amylase. Starch is hydrolysed into maltose.
Stomach
Gastric glands produce gastric juice which contains enzyme pepsin and rennin. Proteins are hydrolysed into polypeptide. Caseinogens is converted into casein.
Duodenum
Liver produces bile. Bile emulsifies lipid. Pancreas produces pancreatic amylase, trypsin & lipase. Starch is hydrolysed into maltose. Polypeptide is hydrolysed into peptide. Lipid is hydrolysed into fatty acids & glycerol.
Ileum
Intestinal gland secretes intestinal juice which contains enzyme maltase, lactase, sucrase and erepsin. Maltase hydrolyses maltose into glucose & glucose. Lactase hydrolyses lactose into glucose and galactose. Sucrase hydrolyses sucrose into glucose & fructose. Erepsin hydrolyses peptide into amino acids

Absorption
Glucose, amino acids, Vitamins B & C are absorbed through facilitated diffusion into blood capillaries in the villi then into hepatic portal vein that leads to liver.

Fatty acids, glycerols, Vitamin ADEK are absorbed into lacteals (FA & G in the form of lipid droplets). Then lacteal converge into lymphatic system. Flows into right lymphatic duct & thoracic duct, finally enters subclavian veins into bloodstream.

Assimilation
In the liver
Liver synthesises plasma proteins from amino acids. Short supply of glucose – liver converts amino acids into glucose. Excess amino acids are broken down – deamination. Urea is produced & transported to kidney to be excreted.
Glucose is converted & stored in the liver. Blood sugar level falls, glycogen is converted back into glucose. Liver full of glucose – converted into lipids.
Lipids enter the heart through subclavian vein transported in the bloodstream to body cells.

In the cells
Amino acids – used for synthesising new protoplasm & repair damaged tissues. Build enzymes & hormones. Synthesise plasma membrane.
Glucose – oxidised to release energy (cellular respiration). Used for muscle contraction, synthesis of proteins. Excess glucose is stored in muscles (glycogen).
Lipids – phospholipids & cholesterol : components of plasma membrane
Fats are stored around organs act as cushions that protect organs from injuries. Excess fats are stored in adipose tissue as reserve energy. When body lacks glucose, fats are oxidised to release energy.

Selasa, 30 Oktober 2012

Just for Fun #1


I've been doing a lot of Chemistry homework lately (General Chemistry II). And a few thoughts have come to mind. I hope you enjoy my Fake test. Don't forget to [subscribe, +1, and share!]

Chemistry test:
Q. What is the pH?
Ans. The ph is silent

Q. What is pOH?

Ans. You really shouldn't use that kind of language on a test

Q. How to get 1 Mol of ion out of water:
Ans. If you fill a Mole hole with water, he should come out by himself

Q. Calculate the half life...
Ans. Usually between 40 and 50 years old (otherwise known as midlife).

Q. What is the result if you add heat to the reaction?
Ans. It gets hot

Q: A precipitation created a blue solution. How do you measure the absorption:
Ans: Photo-Smurf-ometry. You can also use it to set up a standard Smurf


Smurf + Thunder cat = Na'vi





Alternate last question

Q. During a precipitation, you got a blue solution, explain why:
Ans. Smurf-iometry, distinguished from smurf-ometry: the measure of blue-ness.

So, how would you asnwer if I asked you:
Q. balance the following equation:
     1Person + (lots of )time  ----> ?

The Top of the Gob Pile

I was inspecting an area with an acid mine drainage problem last Wednesday for work and we found the source pretty easily: a massive gob pile. What's a gob pile? It's the pile of stuff left over from coal mining. There's a lot of different materials in it, including a lot of shale, giving it a black color. It's an ugly thing that causes lots of problems, but regulation in the US has stopped companies from abandoning them since 1977.

Interestingly enough, there were a few plants growing on the top of the pile, and a few old stumps, which held some biology after all.


This tiny grasshopper blended in with the fall colors, until it jumped onto a patch of moss.


Pixie Cup Lichen, Cladonia pyxidata, grew in a couple patches.


British Soldier Lichen, Cladonia cristatella, made itself known with its bright red caps. Those red caps on the stalks hold its spores.


And since I can never resist turning over a decaying log, I was rewarded with this scarab beetle grub. Not sure what it is, but it's kind of pretty. If you squint a lot, it almost resembles a delicious dumpling.

"Life will find a way."

SIAP SIAP UJIAN NASIONAL


1. Organel sel yang tidak bermembran adalah ....
(A) badan mikro
(B) peroksisom
(C) lisosom
(D) vakuola
(E) ribosom


2. Dalam suatu ekspedisi telah ditemukan tumbuhan dengan ciri-ciri sebagai berikut: tidak berkayu,
berdaun menyirip, tidak berbunga, batang roset,daun muda menggulung. Jika Anda diminta untuk
menduga, tumbuhan kelompok apakah yang Anda temukan tersebut?
(A) Angiospermeae
(B) Monokotiledonae
(C) Pterydophyta
(D) Bryophyta
(E) Gymnospermeae

3. Trenggiling (Manis javanica) merupakan salah satu spesies langka dan dilindungi di Indonesia. Hewan yang hampir seluruh permukaan tubuhnya ditutupi sisik tersebut merupakan pemakan
serangga. Dalam klasififikasi hewan, trenggiling termasuk ke dalam kelompok ....
(A) kelas Reptilia karena tubuhnya bersisik
(B) kelas Insektivora karena merupakan hewan
pemakan serangga
(C) kelas Mamalia karena memiliki rambut dan menyusui
(D) subkelas Squamata karena tubuh ditutupi sisik dan pemakan serangga
(E) subkelas Monotremata karena selain bersisik juga masih bertelur seperti Reptil

4. Fungsi dari neuroglia adalah ....
(A) membantu neuron dalam mempercepat hantaran impuls
(B) membantu neuron menyampaikan rangsang kemis
(C) memperkuat integritas struktur sistem saraf dan fungsi metabolis neuron
(D) membantu neuron dalam pembukaan gerbang Na+
(E) membantu neuron dalam transport kalium, eksresi, dan regenerasi

5. Lapisan sel mati yang terdiri atas beberapa lapisan jaringan epidermis pada akar udara tanaman
anggrek dan berfungsi sebagai jaringan penyimpan air adalah ....
(A) kutikula
(B) trikom
(C) spina
(D) velamen
(E) sel litosit

6. Suatu mikroorganisme menunjukkan pertumbuhan yang terbatas pada suhu 27 _C. Pertumbuhan akan terlihat sangat baik pada suhu 37 _C. Pada suhu 40 _C masih terjadi pertumbuhan, tetapi tidak ada pertumbuhan di atas suhu tersebut. Berdasarkan suhu pertumbuhan maka mikroorganisme tersebut masuk ke dalam kelompok ....
(A) psickrofilik
(B) mesofilik
(C) termotolerant
(D) termofilik
(E) psikotoleran

7. Fertilisasi mengaktifkan serangkaian reaksi yang memungkinkan menyatunya nukleus sel sperma
dan sel telur. Berikut adalah reaksi yang terlibat dalam proses fertilisasi, kecuali ....
(A) reaksi akrosomal
(B) reaksi kortikal
(C) reaksi metabolik
(D) reaksi polispermi
(E) reaksi invaginasi

9. Sekuens ADN pada E. coli yang memulai proses transkripsi dinamakan ....
(A) kodon start
(B) promotor
(C) kodon stop
(D) reading frame
(E) operon

10. Karakteristik yang membedakan cairan hemolimfe Artropoda dengan darah Vertebrata adalah ....
(A) merupakan sistem peredaran tertutup
(B) peredaran cairan hemolimfe bermuara pada rongga jantung
(C) hanya berfungsi sebagai pengangkut sari makanan
(D) hanya berfungsi sebagai pengangkut oksigen
(E) cairan hemolimfe kembali ke jantung melalui pembuluh darah

11. Tumbuhan karnivor, seperti kantung semar, menjebak serangga. Apa yang diperoleh tumbuhan
tersebut dari serangga? Mengapa tumbuhan tersebut menggunakan senyawa tersebut?
(A) Tumbuhan memperoleh air karena hidup pada kondisi kering.
(B) Tumbuhan memperoleh nitrogen untuk membuat gula.
(C) Tumbuhan memperoleh fosfor untuk membuat ATP.
(D) Tumbuhan memperoleh gula karena tumbuhan tersebut tidak dapat memproduksi gula yang
cukup selama fotosintesis.
(E) Tumbuhan memperoleh nitrogen dan fosfor untuk membuat protein.

12. Struktur reproduksi jamur (fungi) merupakan alat utama untuk klasifikasi. Sebutkan urutan filum
dari jamur berdasarkan ciri yang terlihat pada skematis gambar di atas?
(A) Ascomycota, Zygomycota, Deuteromycota ,Basidiomycota
(B) Ascomycota, Basidiomycota, Zygomycota,Ascomycota
(C) Basidiomycota, Basidiomycota, Zygomycota, Ascomycota
(D) Basidiomycota, Deuteromycota, Ascomycota, Zygomycota
(E) Deuteromycota, Basidiomycota, Ascomycota, Zygomycota

13. Lemak yang dihasilkan pada biji kacang tanah merupakan ....
(A) hasil simbiosis dengan bakteri Rhizobium
(B) cadangan makanan pada tumbuhan
(C) senyawa organik yang diserap oleh bulu akar
(D) perubahan biokemis karbohidrat di dalam biji
(E) senyawa nonpolar yang dibentuk pada daun

14. DNA polimerase adalah enzim yang berperan dalam sintesis DNA yang meliputi ....
(A) proses replikasi saja
(B) proses perbaikan saja
(C) proses replikasi dan penambahan
(D) proses replikasi dan perbaikan
(E) proses penambahan dan perbaikan

15. Suatu koloni kapang holomorfis akan memperlihatkan ....
(A) bentuk sel vegetatif saja
(B) bentuk sel generatif dan sel vegetatif
(C) bentuk sel generatif aseksual saja
(D) bentuk sel generatif seksual dan aseksual
(E) bentuk sel vegetatif, sel generatif aseksual, dan seksual

16. Jenis buah yang digolongkan dalam kelompok buah semu adalah ....
(A) kenari
(B) kacang polong
(C) kacang hijau
(D) persik
(E) stroberi

17. Banyaknya lingkaran tahun pada tanaman jati dihasilkan karena adanya aktivitas ....
(A) internodus pada batang
(B) lingkaran-lingkaran berkas pembuluh pada batang tumbuhan monokotil
(C) lapisan xilem dalam batang berkayu
(D) lapisan floem dalam batang berkayu
(E) jawaban b dan c benar

19. Cairan transseluler adalah ....
(A) cairan yang terdapat dalam plasma darah
(B) cairan yang terdapat di ekstraseluler
(C) cairan yang terdapat di intraseluler
(D) cairan yang terdapat di jaringan tubuh
(E) cairan yang terdapat di tempat khusus seperti bola mata, pleura, dan persendian

20. Mitokondria pada sel seorang pasien hanya dapat menggunakan asam lemak dan asam amino untuk respirasi sel dan selnya menghasilkan asam laktat yang cukup tinggi dibandingkan dengan normal. Dari pernyataan berikut, manakah yang paling tepat untuk menjelaskan kondisinya?
(A) Mitokondrianya tidak memiliki protein transpor yang dapat memindahkan asam piruvat dari bagian luar dari membran mitokondria.
(B) Selnya mengalami kelainan pada rantai transpor elektron sehingga glukosa menjadi
asam laktat, bukannya asetil-koA.
(C) Selnya mengandung sesuatu yang menghambat penggunaan oksigen oleh
mitokondria.
(D) Selnya tidak memiliki enzim glikolisis yang membentuk piruvat.
(E) Selnya tidak dapat memindahkan NADH hasil glikolisis.

21. Pernyataan yang manakah yang tidak benar dalam menggambarkan fotosintesis yang terjadi pada tanaman C4?
(A) Hasil pertama dari fiksasi C adalah senyawa dengan 4 atom karbon.
(B) Fotosintesis untuk tanaman C4 teradaptasi untuk tumbuh pada tempat yang panas dan
iklim yang kering.
(C) Fiksasi CO2 berlangsung di sel mesofil, akan tetapi siklus Calvin terjadi pada seludang
pembuluh.
(D) Fotorespirasi pada tanaman C4 lebih sedikit dibandingkan dengan tanaman C3.
(E) ATP yang digunakan untuk sintesis gula lebih sedikit dibandingkan dengan tanaman C3.

22. Sebagian besar ikan, amfibia, reptilia dan burung mempunyai penglihatan warna yang lebih kuat
dibandingkan mamalia. Pernyataan di bawah ini yang mendukung pernyataan tersebut adalah ....
(A) Reseptor penglihatan pada kelompok mamalia tersebar di seluruh retina, tetapi sel batang
hanya terdapat pada fovea.
(B) Hewan nokturnal atau diurnal menentukan jumlah relatif sel batang dan sel kerucut dalam
retina.
(C) Sel batang pada kelompok hewan nokturnal (ikan, amfibia, reptilia dan burung) lebih
berkembang dibandingkan mamalia.
(D) Retina mamalia lebih sedikit mengandung sel batang dibandingkan sel kerucut.
(E) Semua pernyataan benar.

23. Proses fotosintesis yang optimal di kloroplas memerlukan cahaya dengan warna ....
(A) putih
(B) biru
(C) merah
(D) hijau
(E) ungu

24. Proses inisiasi pada sintesis protein dilakukan melalui beberapa protein dan tahapan katalisis.
Katalisator yang digunakan dalam reaksi tersebut adalah ....
(A) ligase
(B) peptidil transferase
(C) topoisomerase
(D) aminoasil-tRNA sintase
(E) helikase

25. Pada sitoplasma Protozoa air tawar terdapat organel yang berfungsi sebagai osmoregulasi, yaitu
(A) plasmasol
(B) plasmagel
(C) vakuola kontratil
(D) selaput plasma
(E) plasmodesma

26. Semua hal di bawah ini berhubungan dengan pertumbuhan sekunder, kecuali ....
(A) terjadi di semua tumbuhan angiosperma
(B) terjadi karena aktivitas prokambium
(C) akibat dari aktivitas (paling tidak sebagian) kambium vaskular
(D) mengakibatkan pertambahan tinggi tanaman
(E) menghasilkan sel-sel endodermis

27. Berdasarkan perbedaan perkembangan embrionya, hewan dapat dikelompokkan menjadi kelompok hewan Protostoma dan Deterostoma. Hewan-hewan yang termasuk ke dalam kelompok
(superfilum) Deterostome adalah ....
(A) ikan, kucing, dan bulu babi
(B) netmatoda, cacing gilig, dan cacing pita
(C) siput, kerang, dan keong
(D) trematoda, cestoda, dan turbelaria
(E) semut, laba-laba, dan kupu-kupu

28. Hubungan langsung antarsel seperti halnya gap junction pada sel hewan dan plasmodesmata pada sel tumbuhan memungkinkan ....
(A) sel-sel di sekitarnya untuk melekat kuat satu dengan lainnya
(B) second messenger yang diproduksi oleh satu sel akan berdifusi dengan cepat dan merangsang
sel-sel di sekitarnya
(C) sel-sel di sekitarnya membentuk penghalang air  yang sangat kuat di antara membran
(D) protein kinase mengalir di antara sel, mengkoordinasi respon seluler dalam suatu
jaringan
(E) pertukaran informasi genetik yang sangat cepat antara sel-sel di sekitarnya

29. Ketika dalam perjalanan mendaki gunung, seorang remaja digigit oleh seekor ular berbisa. Dia hampir saja tewas akibat hemolisis atau sebagian besar sel darah merahnya lisis. Dari hasil analisis terhadap bisa ular tersebut ditemukan tiga buah enzim: fosfolipase yang mendegradasi fosfolipid;
neuraminidase yang melepaskan karbohidrat pada permukaan sel; dan protease yang mendegradasi
protein. Enzim yang menyebabkan hemolisis (hampir saja berakibat fatal) adalah ....
(A) fosfolipase yang akan mendegradasi fosfolipid yang merupakan komponen membran yang membentuk suatu pembatas sel
(B) neuraminidase yang menghancurkan karbohidrat pada membran sel dan selanjutnya Menye babkan sel lisis
(C) protease yang akan mendegradasi protein transmembran yang akan mengakibatkan sel lisis
(D) neuraminidase yang menghancurkan karbohidrat karena karbohidrat merupakan bagian dari glikokaliks
(E) bukan salah satu jawaban di atas

30. Pada proses pembentukan urine, reabsorbsi terjadi di tubulus kontortus proksimal, lengkung Henle dan tubulus kontortus distal. Di tubulus kontortus distal terjadi ....
(A) reabsorbsi glukosa dan asam amino dengan bantuan hormon
(B) reabsorbsi air dan Ca2+ yang dikontrol paratormon
(C) reabsobsi glukosa dan ionNa+ dengan bantuan hormon
(D) reabsorbsi Na+ dan sekresi K+ yang dikontrol hormon aldosteron
(E) reabsorbsi air dan ion Cl��secara pasif

56. Semua hal di bawah ini berhubungan dengan pertumbuhan sekunder, kecuali ....
(A) terjadi di semua tumbuhan angiosperma
(B) terjadi karena aktivitas prokambium
(C) akibat dari aktivitas (paling tidak sebagian) kambium vaskular
(D) mengakibatkan pertambahan tinggi tanaman
(E) menghasilkan sel-sel endodermis

59. Pada sitoplasma Protozoa air tawar terdapat organel yang berfungsi sebagai osmoregulasi, yaitu
(A) plasmasol
(B) plasmagel
(C) vakuola kontratil
(D) selaput plasma
(E) plasmodesma

61. Hubungan langsung antarsel seperti halnya gap junction pada sel hewan dan plasmodesmata pada sel tumbuhan memungkinkan ....
(A) sel-sel di sekitarnya untuk melekat kuat satu dengan lainnya
(B) second messenger yang diproduksi oleh satu sel akan berdifusi dengan cepat dan merangsang
sel-sel di sekitarnya
(C) sel-sel di sekitarnya membentuk penghalang air yang sangat kuat di antara membran
(D) protein kinase mengalir di antara sel, mengkoordinasi respon seluler dalam suatu jaringan
(E) pertukaran informasi genetik yang sangat cepat antara sel-sel di sekitarnya

62. Ketika dalam perjalanan mendaki gunung, seorang remaja digigit oleh seekor ular berbisa. Dia hampir saja tewas akibat hemolisis atau sebagian besar sel darah merahnya lisis. Dari hasil analisis terhadap bisa ular tersebut ditemukan tiga buah enzim: fosfolipase yang mendegradasi fosfolipid;
neuraminidase yang melepaskan karbohidrat pada permukaan sel; dan protease yang mendegradasi
protein. Enzim yang menyebabkan hemolisis (hampir saja berakibat fatal) adalah ....
(A) fosfolipase yang akan mendegradasi fosfolipid yang merupakan komponen membran yang
membentuk suatu pembatas sel
(B) neuraminidase yang menghancurkan karbohidrat pada membran sel dan selanjutnya menyebab kan sel lisis
(C) protease yang akan mendegradasi protein transmembran yang akan mengakibatkan sel lisis
(D) neuraminidase yang menghancurkan karbohidrat karena karbohidrat merupakan bagian dari glikokaliks
(E) bukan salah satu jawaban di atas

63. Berdasarkan perbedaan perkembangan embrionya, hewan dapat dikelompokkan menjadi kelompok hewan Protostoma dan Deterostoma. Hewan-hewan yang termasuk ke dalam kelompok (superfilum) Deterostome adalah ....
(A) ikan, kucing, dan bulu babi
(B) netmatoda, cacing gilig, dan cacing pita
(C) siput, kerang, dan keong
(D) trematoda, cestoda, dan turbelaria
(E) semut, laba-laba, dan kupu-kupu

64. Pertumbuhan diartikan sebagai suat proses perubahan ukuran tubuh suatu makhluk. Berikut merupakan salah satu pertumbuhan pada tumbuhan, yakni …
a. membesarnya batang
b. berbunga
c. berbuah
d. berkecambah
e. terbentuknya rambut akar
2. Perhatikan gambar berikut.

65.Aktivitas pertumbuhan sekunder dari bagian bernomor 3 akan menghasilkan …
a. felem dan feloderm
b. ke arah dalam membentuk felem, ke arah luar membentuk felogen
c. lingkaran tahun dan kambium intravaskuler
d. ke arah dalam membentuk xilem, ke arah luar membentuk floem
e. ke arah dalam membentuk floem, ke arah luar membentuk xilem

66. Pengertian dari temperatur optimum pada proses pertumbuhan adalah …
a. temperatur tertinggi di mana tumbuhan masih dapat hidup
b. temperatur tertinggi di suatu daerah di mana tumbuhan tak dapat hidup
c. temperatur yang dapat memengaruhi tumbuhnya tumbuhan sehingga tumbuhan mudah layu
d. temperatur yang paling sesuai bagi pertumbuhan suatu jenis tumbuhan
e. temperatur terendah di mana tumbuhan masih dapat hidup

67. Suatu tumbuhan mengalami defisiensi unsur Mn2+. Hal yang akan terjadi adalah …
a. tumbuh kerdil
b. batang tumbuh lemah
c. nekrosis
d. daun muda menggulung
e. layu

68. Hormon tumbuhan yang merangsang pertumbuhan sel baru pada jaringan yang luka adalah …
a. kaulokalin
b. auksin
c. asam traumalin
d. filokalin
e. giberelin

69. Ketika tumbuhan mengalami pembelahan sel kelamin pada bunga, tahap tersebut dapat dikatakan sebagai …
a. perkembangan
b. pertumbuhan
c. regenerasi
d. etiolasi
e. reproduksi

70. Perkembangan makhluk hidup dapat diartikan sebagai …
a. penambahan bahan dan perubahan substansi yang dapat diukur
b. penambahan jumlah sel hanya pada titik tumbuh
c. pertambahan volume yang dapat diukur dan bersifat tidak dapat kembali
d. menuju kedewasaan dan tidak dapat diukur
e. perubahan yang berlangsung tanpa batas

71. Dalam perkembangan, tumbuhan dari waktu ke waktu mengalami pertambahan volume dan ukuran. Proses tersebut disebabkan oleh …
a. bertambah banyaknya sel di dalam jaringan
b. bertambah besar dan bertambah banyaknya sel di dalam jaringan
c. pembesaran dan pemanjangan sel
d. bertambah panjangnya sel di dalam jaringan
e. penebalan dinding sel

72. Perkembangan pada makhluk hidup adalah suatu proses …
a. menuju pertumbuhan sekunder
b. pertambahan volume
c. perubahan substansi
d. pertambahan jumlah sel
e. menuju kedewasaan

73. Faktor-faktor eksternal yang memengaruhi pertumbuhan tumbuhan adalah …
a. temperatur, kelembapan, bibit unggul, tanah
b. kelembapan, cahaya, temperatur, genetis
c. cahaya, temperatur, kelembapan, hormon
d. air, kelembapan, temperatur, udara
e. hormon, air, kelembapan, tanah
74. Dalam perkecambahan, biji dipengaruhi oleh beberapa faktor. Faktor-faktor yang pada umumnya diperlukan untuk perkecambahan adalah …
a. oksigen, air, dan keadaan gelap
b. oksigen, temperatur yang hangat, dan air
c. oksigen, temperatur yang hangat, dan terang
d. oksigen, temperatur yang lembap, dan gelap
e. oksigen, sinar, dan karbonsioksida

75. Selain dapat menghambat pembelahan sel, etilen dapat membantu …
a. pengguguran daun
b. pematangan buah
c. pembelahan sel
d. dormansi pucuk
e. perbungaan

76. Pada tumbuhan yang ditanam di tempat gelap akan memiliki ciri sebagai berikut …
a. memiliki daun yang sempit
b. memiliki jaringan mesofil yang tebal
c. kloroplas yang cukup
d. transpirasi yang tinggi
e. tumbuh cepat, tetapi abnormal

77. Kecambah yang tumbuh di tempat gelap, batangnya lebih panjang daripada yang tumbuh di tempat terang. Oleh karena itu, muncul dugaan bahwa …
a. gelap adalah faktor pemacu pertumbuhan
b. cahaya memicu pertumbuhan
c. cahaya menimbulkan pembentukan racun
d. hormon mempercepat pertumbuhan batang
e. cahaya mempercepat pertumbuhan

78. Auksin yang dibentuk pada ujung kecambah akan dipengaruhi oleh cahaya. Apabila disinari pada satu sisi saja, kecambah tersebut akan …
a. tidak tumbuh
b. tumbuh lurus
c. tumbuh ke arah datangnya cahaya
d. tumbuh bengkok
e. tumbuh berlawanan dengan arah datangnya cahaya

79. Tepi daun yang menggulung pada suatu tumbuhan menandakan bahwa tumbuhan tersebut kekurangan unsur …
a. tembaga
b. mangan
c. besi
d. kalium
e. magnesium

80. Perbedaan antara temperatur siang dan malam dapat berpengaruh terhadap pertumbuhan tumbuhan. Respons tumbuhan terhadap pencahayaan tersebut dinamakan …
a. fotoperiodisme
b. long-day plant
c. short-day plant
d. neutral-day plant
e. termodinamika

Biologi dan Peranannya bagi Kehidupan

Biologi berasal dari bahasa Yunani yaitu bios (hidup) dan logos (ilmu). Jadi, Biologi adalah ilmu yang mempelajari segala sesuatu tentang makhluk hidup. Biologi sebagai ilmu dasar bagi ilmu-ilmu terapan seperti ilmu kedokteran, perikanan, pertanian, dan peternakan.

Biologi memelajari makhluk hidup dan benda yang pernah hidup

Biologi sebagai Ilmu
Biologi atau ilmu hayat merupakan bagian dari Ilmu Pengetahuan Alam (IPA) yang sering disebut juga sains. Ilmu Pengetahuan Alam adalah ilmu yang mempelajari gejala alam yang meliputi Fisika, Kimia, Ilmu Pengetahuan Bumi dan Antariksa, serta Biologi.
Biologi sebagai ilmu sains mempunyai beberapa ciri berikut. a. Mempunyai objek kajian berupa benda konkret. Objek dapat dibedakan menjadi objek material dan objek formal. Objek material merupakan objek yang dibahas, sedangkan objek formal merupakan cara memandang objek tersebut. Contoh objek material dari Biologi berupa makhluk hidup dan makhluk yang pernah hidup termasuk fosil. Adapun objek formal Biologi berupa struktur, fungsi, dan interaksi dari makhluk hidup tersebut. b. Dikembangkan berdasarkan pengalaman empiris, yaitu pengalaman nyata yang dapat dilakukan oleh setiap orang. c. Sistematis, yaitu menggunakan langkah-langkah yang urut dan bersifat baku. d. Menggunakan cara berpikir yang logis dan konsisten. e. Hasil kajiannya bersifat objektif. f. Teori yang dihasilkan berlaku umum.
Biologi hanya mempelajari makhluk hidup, seolah-olah Biologi merupakan ilmu yang berdiri sendiri. Semakin berkembangnya permasalahan yang dihadapi manusia maka Biologi pada saat ini perlu didukung oleh cabangcabang Ilmu Pengetahuan Alam yang lain, yaitu Kimia dan Fisika. Selain itu, Biologi juga dapat didukung oleh cabang-cabang Ilmu Pengetahuan Sosial, seperti Sejarah, Ekonomi, dan Hukum.
Setiap cabang ilmu pengetahuan tersebut saling berhubungan sehingga dapat dimanfaatkan untuk memecahkan permasalahan-permasalahan dalam kehidupan. Setiap permasalahan perlu diteliti secara ilmiah sehingga diperoleh kebenaran ilmiah yang dapat digunakan sebagai sarana untuk memecahkan masalah. Namun, kebenaran ilmiah bukanlah kebenaran yang mutlak. Kebenaran ilmiah bersifat relatif. Para peneliti perlu melakukan penelitian yang terus-menerus untuk menyempurnakan kebenaran ilmiah yang ada sekarang.
Sumber Pustaka
  • Raven & Johnson. 1987. Biology. Fourth Edition. New York: WBC/McGraw-Hill Companies, Inc.

Senin, 29 Oktober 2012

October 30th, 2012

Today students are to design their own controlled experiment. I have included the example we covered in class so students can see what a finish product will look like. The vine experiment I used in class yesterday is written up along with the definition for a controlled experiment. Students should read and look over my example prior to beginning their own hypothetical controlled experiment. If students finish the project prior to the end of class, there are several things they need to be working on.
     Students will either hand in a paper/pencil copy of their controlled experiment or they should be able to submit their electronic copy to me at the end of the hour.

1) All biology students have a two page book report due on Friday.
2) Some students have questions that are not completed, so they should work on getting them finished up.
3) We have a semester final on Friday, covering the controlled experiment information as well as past materials over photosynthesis, cell respiration, tree physiology, tree parts, the water cycle and watersheds. This will be a cumulative test, so all information we covered through the trimester may be put on the final test. Of course not all of it will be there, but it is all fair game to study.

Molly Cornelison needs to take her test during 4th hour. I was going to have her take it after school on Wed, but she can do todays work as homework and get the test done during the hour.


Vine Controlled Experiment

Witch Hazel

Hamamelis virginiana is a common shrub or small tree on the forested slopes of the dune country in Indiana. It also occurs away from the dunes region, often on ravine slopes. The leaves are wavy-margined and noticeably asymmetrical. Interestingly, the flowers emerge in autumn, and in a mild year can sometimes be observed well into December. Watch for the occasional pink-flowered forma rubescens.

In a journal entry dated September 21, 1859, Henry David Thoreau wrote, "Heard in the night a snapping sound, and the fall of some small body on the floor from time to time. In the morning I found it was produced by the witch hazelnuts on my desk springing open and casting their seeds quite across my chamber, hard and stony as these nuts were. For several days they are shooting their shining black seeds about my chamber."

In a delightful book entitled "Of Woods and Other Things," the inimitable Emma Pitcher wrote, "Everything else in the woods is going to sleep in the frosts and cold of October and November when witch hazel is in full blossom. We found lingering petals on a Christmas Day stroll."
 In earlier times, a forked branch of witch-hazel was sometimes used as a “divining rod” for “water witching,” which was believed to locate good sites for digging wells.
Photographed on October 31, 2012 in Marshall County, Indiana.

The Benefits of Quitting Smoking

Are you a smoker? Are you one of those who believe that smoking may not be as dangerous as “they” say it is?

Well, thirty years ago you’d have had a point.  It’s actually taken a long time to collect sufficient data to prove that smoking is as harmful as it is.  That’s because smoking-related diseases can take decades to develop.  Only after an entire generation of smokers reaches old age can we truly know the health-and-survival differences between smokers and non-smokers.  But the data are now becoming available, and its pretty convincing.  A 12-year-long British study of 1.2 million women born between 1938 and 1945 shows that women who smoked throughout their lives shortened their lives on average by more than ten years.  Ten years!  (The study was conducted in women born between 1938 and 1945 because smoking only became popular among women in the 1950s, when these women were entering their teens.)

Now for the good news.  Smokers who quit markedly reduced their risk of smoking-related diseases and a shortened lifespan.  How much their risk was reduced depended on the age at which they quit. For example, women who quit by age 40 lowered their smoking-related risk of death by 90%. Women who quit by age 30 lowered their risk by a whopping 97%.

What this means is that if you quit while you are still young, you can still live a long and normal life. Is that enough incentive for you to quit?




October 29th 2012

Today we worked on the understanding of the Scientific Method and a Controlled Experiment. I put an experiment on the board that allowed students to see how to establish the control and experimental groups. It also discussed the Dependent and Independent variable and all the factors that have to be the same. The notes from today's work is posted on the link below.

Controlled Experiment Notes

Minggu, 28 Oktober 2012

Bioactive Compounds in Foods





DOWNLOAD

Password: biology-community.blogspot.com

Book Description



Inherent toxicants and processing contaminants are both non-essential, bioactive substances whose levels in foods can be difficult to control. This volume covers both types of compound for the first time, examining their beneficial as well as their undesirable effects in the human diet. Chapters have been written as

KODOGEN TO KODON


  • Transkripsi merupakan pembentukan/sintesis RNA dari salah satu rantai DNA, sehingga terjadi proses pemindahan informasi genetik dari DNA ke RNA. 
  • Pemindahan kode geneteik dari Kodogen DNA ke Kodon m RNA
  • Fungsi ini disebut fungsi heterokatalis DNA karena DNA mampu mensintesis senyawa lain yaitu RNA. 
  • Sebuah rantai DNA digunakan untuk mencetak rantai tunggal mRNA dengan bantuan enzim polimerase. 
  • Enzim tersebut menempel pada kodon permulaan, umumnya adalah kodon untuk asam amino metionin. 
  • Pertama-tama, ikatan hidrogen di bagian DNA yang disalin terbuka. Akibatnya, dua utas DNA berpisah. 
  • Salah satu polinukleotida berfungsi sebagai pencetak atau sense, yang lain sebagai gen atau antisense. 
  • Misalnya pencetak memiliki urutan basa G-A-G-A-C-T, dan yang berfungsi sebagai gen memiliki urutan basa komplemen C-T-C-T-G-A. 
  • Karena pencetaknya G-A-G-A-C-T, maka RNA hasil cetakannya C-U-C-U-G-A. Jadi, RNA C-U-C-U-G-A merupakan hasil kopian dari DNA C-T-C-T-G-A (gen), dan merupakan komplemen dari pencetak.
  • Transkripsi DNA akan menghasilkan mRNA (messenger RNA). 
  • Pada organisme eukariot, mRNA yang dihasilkan itu tidak langsung dapat berfungsi dalam sintesis polipeptida, sebab masih mengandung segmen-segmen yang tidak berfungsi yang disebut intron. 
  • Sedangkan segmen-segmen yang berfungsi untuk sintesis protein disebut ekson. 
  • Di dalam nukleus terjadi pematangan/pemasakan mRNA yaitu dengan jalan melepaskan segmen-segmen intron dan merangkaikan segmen-segmen ekson. 
  • Gabungan segmen-segmen ekson membentuk satu rantai/utas mRNA yang mengandung sejumlah kodon untuk penyusunan polipeptida. 
  • Rantai mRNA ini dikenal sebagai sistron.


Gb. Proses pematangan mRNA dengan membuang bagian  intron

  • Proses transkripsi ini terjadi di dalam inti sel (nukleus). 
  • DNA tetap berada di dalam nukleus, sedangkan hasil transkripsinya dikeluarkan dari nukleus menuju sitoplasma dan melekat pada ribosom. 
  • Ini dimaksudkan agar gen asli tetap terlindung, sementara hasil kopinya ditugaskan untuk melaksanakan pesan-pesan yang dikandungnya. 
  • Jika RNA rusak, akan segera diganti dengan hasil kopian yang baru

Transkripsi pemindahan kode genetik DNA ke RNA m ini melalui tiga langkah yaitu 

1.   Inisiasi (permulaan)
  • Daerah DNA di mana RNA polimerase melekat dan mengawali transkripsi disebut sebagai promoter. Suatu promoter menentukan di mana transkripsi dimulai, juga menentukan yang mana dari kedua untai heliks DNA yang digunakan sebagai cetakan.

2.   Elongasi (pemanjangan)
  • Saat RNA bergerak di sepanjang DNA, RNA membuka untaian heliks ganda DNA dengan bantuan enzim polimerase, sehingga terbentuklah molekul RNA yang akan lepas dari cetakan DNA-nya.

3.  Terminasi (pengakhiran)
  • Transkripsi berlangsung sampai RNA polimerase mentranskripsi urutan DNA yang disebut terminator. Terminator yang ditranskripsi merupakan suatu urutan RNA yang berfungsi sebagai kodon terminasi (kode stop) yang sesungguhnya. Pada sel prokariotik, transkripsi biasanya berhenti tepat pada akhir kodon terminasi, yaitu ketika polimerase mencapai titik terminasi sambil melepas RNA dan DNA. Sebaliknya, pada sel eukariotik polimerase terus melewati sinyal terminasi, suatu urutan AAUAAA di dalam mRNA. Pada titik yang jauh kira-kira 10 hingga 35 nukleotida, mRNA ini dipotong hingga terlepas dari enzim tersebut.
DETAIL TRANSKRIPSI SEL PROKARYOTIK DAN EUKARYOTIK

  • Selain mekanisme dasar yg hampir sama, pada eukariot dan prokariot keduanya memiliki prinsip sama pada proses transkripsinya:
  • Prekursor untuk sintesis RNA ada 4 macam: 5′-trifosfat 

  1. ATP
  2. GTP
  3. CTP
  4. UTP ( g ada thymine pada RNA)
  • Reaksi polimerisasi atau pemanjangan RNA sama dengan replikasi DNA yaitu dengan arah 5′ -> 3′ (5 ' ke 3')\
  • Urutan nukleotida RNA hasil sintesis ditentukan oleh urutan DNA template ( Dna Sense)
  • Untai DNA yang berperan sebagai cetakan hanya salah satu untai
  • Dan produk hasil transkripsi berupa RNA untai tunggal

Transkripsi pada Prokariot
  • Salah satu ciri dari prokariot adalah adanya struktur operon. 
  • Operon adalah organisasi dari beberapa gen yang ekspresinya dikendalikan oleh satu promotor. 
  • Misal operon lac, pada metabolisme laktosa pada bakteri E.coli
  • Pada waktu ditranskripsi operon lac akan menghasilkan satu mRNA yang membawa kode2 genetik untuk polipeptida berbeda yang disebut dengan mRNA polisistronik.


  • Sesuai gambar di atas, pada operon lac punya 3 gen struktural yaitu lac Z, lac Y dan lac A. 
  • Lac lac ini secara umum untuk proses metabolisme lactosa sendiri ( membentuk energi ) secara detail terdiri dari Transferase , galaktosidase dan Permease. Nama -nama itu berarti transfer: membentuk suatu protein yang berperan mentranslokasikan laktosa ke dalam sel, galaktosidase itu adalah suatu kelas enzim untuk memecah laktosa yang ada di dalam sel, dsb....
  • Masing2 dari gen itu punya start codon dan stop codon sendiri2 namun ekspresinya tetep dikendalikan  oleh operon yg sama. 
  • Kemudian waktu ditranskripsi hasilnya 1 mRNA yg membawa kodon kodon 
  • Yang kodon itu membentuk 3 macam polipeptida yg beda. 
  • Setelah itu dilanjutkan dengan translasinya 
  • Prosesnya bagaimana ? nanti yanng pasti akan jadi 3 polipeptida yang independen Description: :D

Struktur Gen Prokariot

  • Pada prokariot gennya secara umum tersusun atas promotor, bagian struktural, dan terminator

Promotor

  • Promotor adalah urutan DNA spesifik yang berperan dalam mengendalaikan transkripsi gen struktural dan terletak di daerah upstream (hulu) dari bagian struktural gen.
  • Fungsi promotor? 
  • Sebagai tempat awal pelekatan enzim RNA polimerase yang nantinya melakukan transkripsi pada bagian struktural
  • Pada prokariot bagian penting promotornya disebut sebagai Pribnow box pada urutan nukleotida -10 dan -35. 
  • Biasanya berupa TATA box.
Apa fungsi dari pribnow box
  • Pribnow box merupakan daerah tempat pembukaan heliks DNA untuk membentuk kompleks promotor terbuka. 
  • Jadi di TATA box itulah DNA dipisahkan dan kalau di luar TATA box helix DNA nya tetep berikatan
  • Intinya tatabox berfungsi sebagai sekuens agar trankripsi dimulai pada lokasi yang spesifik yakni melalui bantuan sigma factor....


Operator
  • Operator merupakan urutan nukelotida yang terletak di antara promotor dan bagian struktural dan merupakan tempat pelekatan protein represor (penekan atau penghambat ekspresi gen). 
  • Jika ada represor yang melekat di operator maka RNA polimerase g bisa jalan trus ekspresi gen tidak bisa berlangsung.
  • Pada gambar di atas operator disimbolkan dengan warna ungu yg berada di antara promotor (merah) dan structural gene (hijau).
  • Selain adanya supresor ada juga yg namanya enhancer. 
  • Supresor untuk menghambat 
  • Enhancer kebalikannya, Enhancer justru meningkatkan transkripsi dengan meningkatkan jumlah RNA polimerase. 
  • Namun letaknya tidak pada lokasi yang spesifik seperti operator
  • Ada yang jauh di upstreamatau bahkan downstream dari titik awal transkripsi.

Coding Region
  • Gen struktural merupakan bagian yang mengkode urutan nukleotida RNA. 
  • Transkripsi dimulai dari sekuens inisiasi transkripsi (ATG) sampai kodon stop (TAA / TGA / TAG).
  • Pada prokariot tidak ada sekuens intron (yg tidak dapat diekspresikan) sehingga semuanya berupa ekson. 
  • Namun kadang pada archaebacteria dan bakteriofag ada yg memiliki intron.

Terminator
  • Dicirkan dengan struktur jepit rambut / hairpin dan lengkungan yang kaya yang akan urutan GC yang terbentuk pada molekul RNA hasil transkripsi.

RNA Polimerase
  • RNA polimerase merupakan enzim yang mengkatalisis proses transkripsi. 
  • Jika susunannya lengkap misalnya α2ββ’σ disebut holoenzim. 
  • Sedang jika g ada σ cuma α2ββ’ disebut core-enzyme.

Fungsi subunit2 itu:
α = diduga berfungsi dalam penyusunan enzim
β = berfungsi dalam pengikatan nukleotida
β’ = berfungsi dalam penempelan DNA
σ = berfungsi untuk mengarahkan agar RNA polimerase menempel pada promotor.

Mekanisme Transkripsi
Inisiasi
  • Pembentukan kompleks promoter tertutup
  • RNA polimerase menuju ke promoter atas bantuan faktor σ. 
  • Jika diibaratkan pesawat, sigma itu antenanya
  • Kemudian promotor itu bandaranya. Kan pesawat selalu mendarat di bandara, dibantu ama signal.

Pembentukan kompleks promoter terbuka
  • Bagian DNA yang berikatan dengan RNA polimerase membentuk struktur gelembung transkripsi (transcription bubble) yang stabil.
  • Penggabungan beberapa nukleotida awal
  • Dalam transkripsi nukleotida RNA digabung hingga membentuk transkrip RNA. 
  • Awal nya  basa2 RNA yang digabung membentuk ikatan hidrogen dengan basa DNA cetakan
  • Pelepasan subunit σ dan perubahan konformasi holoenzim jadi core enzyme
  • Setelah inisiasi terjadi, subunit σ terlepas dari enzim inti dan dapat digunakan oleh enzim inti RNA polimerase lain.

Elongasi
  • Dalam elongasi, nukleotida ditambahkan secara kovalen pada ujung 3′ molekul RNA yg baru terbentuk (RNA baru terbentuk dgn arah 5′ -> 3′) yang menggunakan ikatan fosfodiester. 
  • Nukleotida RNA yg ditambahkan bersifat komplementer dgn nukleotida untai DNA cetakan.

Terminasi
Penghentian transkripsi atau terminator ada 2:
  1. Rho-independent
  2. Rho-dependent
Rho-independent 
  • Yaitu terminasi ditentukan urutan nukleotida.  
  • DIcirikan struktur jepit rambut / hairpin yang kaya akan basa GC. 
  • Mekanisme pemisahan? 
  • Akibat struktur itu, RNA polimerase ntr berhenti dan meruka bagian dari sambungan (hibrid) DNA-RNA.
  • Kemudian sisa hibridnya merupakan urutan oligo U (rU) yg tidak cukup stabil berpasangan dengan A (dA) -> ikatan hidrogen cuma 2. 
  • Akibatnya Lepasnya ikatan lemah tersebut dan RNA hasil transkripsi lepas Description: :)
Rho-dependent 
  • yaitu terminasi memerlukan protein rho. 
  • Faktor rho terikat pada RNA transkrip kemudian ngikut RNA polimerase sampe ke daerah terminator. 
  • Kemudian faktor rho membuat destabilisasi ikatan RNA-DNA hingga RNA terlepas

Transkripsi pada Eukariot

Struktur gen
  • Secara umum hampir sama ama prokariot ada promotor, bagian struktural dan terminator. Yg beda pada bagian strukturalnya

Bagian struktural pada eukariot
  • Kenapa bagian struktural/coding region nya beda? 
  • karena jika pada sel eukariot ada bagian intron dan ekson.

Intron (intervening sequences
  • Merupakan sekuens yg tidak mengkode asam amino. 
  • Jika pada gambar yang warnanya biru muda agak hijau 
  • Bagian ini akan dibuang saat pematangan RNA . OK

Ekson 
  • Sekuens yg nantinya dikode jd asam amino. 
  • Pada gambar warnanya merah

Mekanisme Transkripsi
  • Pada sel eukariot RNA polimerasenya beda2 ada RNA polimerase I, II dan III. 
  • Dan penggunaannya dalam sintesis molekul beda.
  • Sebelum RNA polimerase nempel di promotor, ada faktor transkripsi yang bantu ng-guide si RNA polimerase. 
  • Jika pada RNA polimerase I guidenya SL1 dan UBF
  • Pada RNA polimerase II dibantu ama TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH dan TFIIJ (banyak banget ==”).
  • Sedang RNA polimerase III dipandu ama TFIIIA, TFIIIB, TFIIIC ama protein TBP.
  • Faktor TBP merupakan protein yang diperlukan jika gen2 g punya TATA box.
  • Kemudian setelah si RNA polimerase dibantu oleh faktor transkripsi (TF) ke TATA box baru terjadi proses elongasi dan berhenti sampai ketemu terminator. OK

Proses pasca-transkripsi
  • Dengan adanya intron pada eukariot, makanya mRNA yg dihasilkan g bisa langsung dikeluarin ke sitosol untuk ditranslasi namun harus diolah dulu. 
Caranya terus bagaimana ?
  1. Splicing
  2. poly\iadeilasi
  3. Capping

Splicing
  • Merupakan proses pembuangan intron dan penyambungan ekson. 
  • Awalnya RNA hasil transkripsi pd eukariot disebut pre-mRNA karena masih ada intronnya. 
  • kemudian intron akan dipotong dan ekson2 disambung menjadi mRNA matang (mature mRNA).  
  • Intron dipotong pake spliceosome. lalu penyambungan ekson2 menggunakan enzim ligase.

Poliadenilasi
  • Merupakan proses penambahan poliA (rantai AMP) pada ujung 3′ nukleotida mRNA. 
  • Fungsinya? untuk meningkatkan stabilitas mRNA dan meningkatkan efisiensi translasinya.

Capping
  • Penambahan tudung mRNA berupa molekul 7-metilguanosin. 
Fungsinya Capping adalah :
  1. Melindungi mRNA dari degradasi
  2. Meningkatkan efisiensi translasi mRNA
  3. Meningkatkan pengangkutan mRNA dari nukelus ke sitoplasma
  4. Meningkatkan efisiensi proses splicing\